内镜中心内设有电子胃镜室、肠镜室、十二指肠镜室、超声内镜室、双气囊小肠镜和胶囊内镜室、支气管镜室、电子喉镜及鼻内窥镜室、胆道镜室、膀胱镜及输尿管镜室和宫腔镜室等，是目前省内整体规模较大的内镜中心之一
内镜中心引进了先进的一体化内镜清洗中心，使内镜经过初清洗、酶洗、浸泡消毒、末清洗等技术流程，达到彻底清洗的良好效果，为预防院内感染提供了更加可靠而安全的保证。
内镜中心目前可以开展各种内镜检查和治疗，特别是无痛的胃、肠镜的检查，双气囊小肠镜和胶囊内镜检查，输尿管镜检查及治疗，支气管镜的检查及治疗；其中十二指肠镜治疗胆胰疾病和黏膜下剥离术(ESD)治疗达到省内领先地位。
